羅丹明染料是熒光素的補(bǔ)充劑，因?yàn)樗鼈兲峁└L(zhǎng)波長(zhǎng)的發(fā)射*大值，并為多色標(biāo)記和染色提供了機(jī)會(huì)。 羅丹明的光穩(wěn)定性高于熒光素和香豆素。 羧基四甲基羅丹明（TAMRA）是用于制備寡核苷酸綴合物的常見(jiàn)熒光團(tuán)。 磺酰羅丹明101磺胺氯化物（TexasRed®）是另一種流行的寡核苷酸標(biāo)記染料。 然而，TexasRed®不穩(wěn)定，與其他羧基羅丹明染料（如5-TAMRA，SE）相比，其偶聯(lián)產(chǎn)率低得多。
AAT Bioquest研發(fā)了California Red?取代了TexasRed®。 California Red?具有與TexasRed®幾乎相同的光譜特性和類似的水溶性。 California Red?更穩(wěn)定，并且比TexasRed®具有更高的共軛產(chǎn)率。
圖1.用于標(biāo)記寡核苷酸的典型羅丹明染料的化學(xué)結(jié)構(gòu)
表2.用于標(biāo)記寡核苷酸的羅丹明染料
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貨號(hào)
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產(chǎn)品名稱
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規(guī)格
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Ex (nm)
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Em (nm)
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EC (cm-1 M-1)
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CF @260 nm
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價(jià)格
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479
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核酸多肽蛋白標(biāo)記 California Red SE
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1 mg
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583
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603
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100,000
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0.456
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1140
|
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473
|
核酸多肽蛋白標(biāo)記 California Red SE
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5mg
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583
|
603
|
100,000
|
0.456
|
1740
|
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470
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麗絲胺堿性蕊香紅B磺酰氯 CAS 62796-29-6
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100 mg
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568
|
583
|
85,000
|
0.288
|
1140
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380
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5(6)-ROX 5(6)-羧基-X-羅丹明 CAS 198978-94-8
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100 mg
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568
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591
|
85,000
|
0.301
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5940
|
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390
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5(6)-ROX, SE 5(6)-羧基-X-羅丹明琥珀酰亞胺酯
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25 mg
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576
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601
|
93,000
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0.301
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2340
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495
|
6-ROX 6-羧基-X-羅丹明炔烴
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5 mg
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575
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602
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95,000
|
0.307
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1740
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494
|
6-ROX 6-羧基-X-羅丹明疊氮化物
|
5 mg
|
575
|
602
|
95,000
|
0.307
|
1740
|
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426
|
6-ROX 6-羧基-C2-羅丹明馬來(lái)酰亞胺
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1 mg
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575
|
602
|
95,000
|
0.307
|
1140
|
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392
|
6-ROX, SE 6-羧基-X-羅丹明琥珀酰亞胺酯 CAS 216699-36-4
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5 mg
|
575
|
602
|
95,000
|
0.307
|
1140
|
|
480
|
磺基羅丹明101磺酰氯
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10 mg
|
588
|
601
|
100,000
|
0.456
|
1140
|
|
370
|
5(6)-TAMRA, SE 5(6)-羧基四甲基羅丹明琥珀酰亞胺酯 CAS 246256-50-8
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25 mg
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546
|
575
|
75,000
|
0.320
|
1140
|
|
423
|
5(6)-TAMRA C6 馬來(lái)酰亞胺
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5 mg
|
544
|
575
|
75,000
|
0.320
|
1140
|
|
491
|
6-TAMRA 6-羧基四甲基羅丹明炔烴
|
5 mg
|
547
|
573
|
75,000
|
0.335
|
1740
|
|
490
|
6-TAMRA 6-羧基四甲基羅丹明疊氮化物
|
5 mg
|
547
|
573
|
75,000
|
0.335
|
1740
|
|
425
|
6-TAMRA 6羧基四甲基羅丹明-C6-馬來(lái)酰亞胺
|
5 mg
|
544
|
575
|
75,000
|
0.335
|
2340
|
|
357
|
6-羧基四甲基羅丹明尸胺 6-TAMRA cadaverine
|
5 mg
|
544
|
575
|
75,000
|
0.335
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3540
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6051
|
6-TAMRA 6-羧基四甲基羅丹明 CPG*1000 ?*
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1 g
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546
|
578
|
75,000
|
0.335
|
5940
|
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359
|
6-羧基四甲基羅丹明乙二胺 6-TAMRA ethylenediamine
|
5 mg
|
544
|
575
|
75,000
|
0.335
|
2340
|
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419
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6-TAMRA 6羧基四甲基羅丹明馬來(lái)酰亞胺 CAS 174568-68-4
|
1 mg
|
540
|
567
|
75,000
|
0.335
|
2340
|
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376
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6-TAMRA, SE 6-羧基四甲基羅丹明琥珀酰亞胺酯 CAS 150810-69-8
|
5 mg
|
547
|
573
|
78,000
|
0.335
|
1188
|
|
485
|
Texas Red 炔烴
|
5 mg
|
588
|
601
|
95,000
|
0.456
|
1740
|
|
484
|
Texas Red 疊氮化物
|
5 mg
|
588
|
601
|
95,000
|
0.456
|
1740
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